В 2003р. завершив навчання в Київській духовній академії захистивши дисертацію зі здобуттям ступеня кандидата богословських наук.
З 2003 по 2006 роки, викладав у Київській духовній академії та семінарії і на богословському відділенні Чернівецького національного університету.
З 10 листопада 2003 р. - здійснював послух особистого секретаря глави Церкви і виконував обов’язки керуючого справами Патріархії.
З 22 лютого 2005 р. — намісник Свято-Феодосіївського монастиря м. Києва.
В 26-річному віці очолив єпархію.
Рішенням Священного Синоду від 28 лютого 2006 р. обраний на єпископа Тернопільського і Бучацького. Очолена Святішим Патріархом Філаретом архієрейська хіротонія відбулася 5 березня 2006 у Володимирському кафедральному соборі Києва.
14 грудня 2006 р. удостоєний вищої церковної нагороди - Ордену Святого Юрія Переможця.
23 січня 2012 Указом Святійшого Патріарха Філарета возведений в сан архієпископа.
Ставши архієпископом, й надалі продовжує викладати в Чернівецькому університеті та у Волинській Православній богословській академії. Оскільки у владики Нестора немає можливості регулярно щотижня їздити і до Чернівців, і до Луцька, то викладання проводить за допомогою інтернету: дистанційно з Тернополя за допомогою Skype. Він є прогресивним священнослужителем, який свого часу власноруч створив для своєї єпархії перший сайт.
Рішенням Священного Синоду від 13 травня 2012 року призначений керуючим Тернопільсько-Кременецькою єпархією (за сумісництвом). 20 жовтня 2012 року призначений єдиним керуючим архієреєм Тернопільсько-Кременецької і Тернопільсько-Бучацької єпархій Української Православної Церкви Київського Патріархату з титулом архієпископ «Тернопільський, Кременецький і Бучацький».
З 25 травня 2018 призначений капеланом Пласту — Національної скаутської організації України від УПЦ КП
З 15 грудня 2018 року - архієрей Православної церкви України.